الگوریتم های خوشه بندی دوبعدی در داده های بیان ژنی: یک مطالعه مروری

در سال های اخیر تکنولوژی ریز آرایه امکان مشاهده و بررسی بیان هم زمان هزاران ژن را وقتی سلول تحت شرایط مختلف یا پروسه های متفاوت قرار می گیرد را فراهم کرده است و نقشی اساسی در سرعت بخشیدن و بالا رفتن کارایی مطالعات بیان ژنی ایفا می کند. یکی از مهم ترین تکنیک های تشخیص الگو در داده های بیان ژنی تحلیل خوشه بندی دوبعدی است که می تواند گروه هایی از ژن ها با الگو های بیان شده مشابه را بیابد. مطالعه حاضر که یک مطالعه مروری است با هدف ارزیابی پژوهش های موجود در زمینه خوشه بندی دوبعدی بیان ژن و بررسی الگوریتم های مختلف، انجام شده است. در این مطالعه الگوریتم های معرفی شده در سال های 2000 تا 2014 میلادی مورد ارزیابی قرار گرفته است. نتایج جستجو در سایت های مختلف شامل 17الگوریتم اصلی بود که همه آن ها به زبان انگلیسی چاپ شده بودند. با استفاده از نتایج به دست آمده از این مطالعه، بهترین الگوریتم های موجود مربوط به الگوی داده کاوی رابطه بود. اما این تکنیک به این دلیل که از روش جستجوی فراگیر استفاده می کند و همه فضاهای مربوط به خوشه های دوبعدی را پیدا می کند لذا بسیار وقت گیر و پرهزینه است. به نظر می رسد نیاز است بر روی سایر الگوریتم های ارائه شده راه کارهایی جهت رفع مشکلات موجود پیاده کرد تا بتوان نتایج قابل قبول تری به دست آورد.